Hola lumer!
No te preocupes lo más mínimo.
En primer lugar, para saber cual es el aporte de CO2 lo mejor es un drop checker, que te lo puedes comprar en plan bonito o hacértelo tú mismo (aquí
un buen ejemplo)
El drop checker te va a medir la cantidad de CO2 que hay en el agua, no sin cierto margen de error y algo de desfase (ambas cuestiones, sin importancia práctica).
Contar burbujas no me parece un buen sistema porque, por un lado, las burbujas varían de tamaño, es decir, algunos contarán burbujitas y otros burbujotes. Por otro lado, poco importa la cantidad de CO2 que se aporta si no tenemos en cuenta su forma de disolución en el agua. De todas las formas de disolución hay algunas más eficaces que otras, así que con el mismo aporte de CO2, la cantidad que se queda en el agua del acuario será diferente. No es lo mismo una piedra difusora que un atomizador.
En segundo lugar, puesto que usas CO2 casero, conocer el aporte en burbujas sólo es útil para saber cuando se te está acabando, ya que durante el resto del tiempo no puedes regular la producción de CO2.
Por cierto ¿de cuantos litros es tu acuario y de qué volumen la botella de CO2 casero?
Saludos!